La UTPL fue fundada por la Asociación Marista Ecuatoriana (AME) el 3 de mayo de 1971 y desde octubre de 1997, la Diócesis de Loja traspasa por tiempo indefinido a la "Asociación Id de Cristo Redentor, Misioneros y Misioneras Identes" la conducción y dirección de la Universidad.

Brinda educación superior de pre y postgrado a través de las modalidades de estudio: Presencial, Abierta y a Distancia, con sus variantes: A distancia tradicional, Semipresencial y Virtual, en cuatro áreas del conocimiento: Área Técnica, Área Socio-Humanística, Área Biológica y Área Administrativa.

Adicionalmente, las funciones de investigación y extensión o servicio a la sociedad, están estructuradas en la universidad como Centros de Investigación, Transferencia de Tecnología, Extensión y Servicios - CITTES -, unidades constituidas en torno a áreas específicas del conocimiento que contribuyen al autofinanciamiento de la universidad.

La Escuela de Medicina ha incorporado a la sociedad 5 promociones de médicos y cuenta con el CITTES de Ciencias médicas que nace en marzo de 2004, a través de la Unidad de Medicina Familiar. Su propósito es establecer un modelo de gestión, desde las líneas de investigación, de una manera productiva al servicio de la comunidad, integrando en las mismas la actividad docente y la formación de los estudiantes universitarios.

Se encuentra desarrollando algunos proyectos de investigación, entre ellos:

- EL PROYECTO TELESALUD UTPL “TUTUPALY”: que se encuentra en su quinto año de ejecución y es uno de los proyectos PIONEROS de su género en el ECUADOR, realizado en convenio con el MSP, se basa en tres ejes fundamentales: TELECONSULTA, TELEEPIDEMIOLOGÍA y TELEEDUCACIÓN. En este proyecto han participado 29 médicos rurales distribuidos en los cantones El Pangui y Yacuambi integrando la parte médica con las herramientas de tecnología de información y comunicación, para mejorar la cobertura de atención de salud en las zonas apartadas de la Amazonía mediante las conexiones satelitales, internet las 24 horas del día, y servicio de voz IP (telefonía) en las unidades operativas de salud del Área # 1 de Zamora Chinchipe.